La Dirección de Postgrado, dependiente de la Vicerrectoría de Investigación, Innovación y Postgrado, tiene como propósito la implementación y articulación sistemática de políticas, normativas y procesos, que permitan contar con condiciones y servicios relativos a la organización, coordinación, y funcionamiento de los programas de magíster, sustentados en información actualizada y transparente, en el marco de la calidad académica , la pertinencia de su oferta académica y el mejoramiento continuo de los programas.
En la actualidad, la Universidad ofrece 22 Magíster, de carácter disciplinar e interdisciplinar, dictados en modalidades presenciales y Online, tanto en Santiago como en la sede Regional de Coquimbo, con un 35% de dichos programas acreditados por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA).